Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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