Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm36120-201ENSMUST00000214393 1734 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm43080-201ENSMUST00000199006 2643 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Wdr11-201ENSMUST00000084519 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 CT030170.4-201ENSMUST00000221539 1538 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 U2af1l4-204ENSMUST00000163464 651 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms