Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Hecw1-201ENSMUST00000110516 9460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtpraP18052 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms