Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Usp35M0QWN7 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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Usp35M0QWN7 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Usp35M0QWN7 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Usp35M0QWN7 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Usp35M0QWN7 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Usp35M0QWN7 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Usp35M0QWN7 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Usp35M0QWN7 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Usp35M0QWN7 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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