Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms