Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Hnf4g-201ENSMUST00000108393 2224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Pnma2-202ENSMUST00000122431 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Olfr374-202ENSMUST00000210435 8718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Zfp961-201ENSMUST00000109997 2713 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 CT030170.4-201ENSMUST00000221539 1538 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Rapgef4-202ENSMUST00000090826 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 4930407I10Rik-201ENSMUST00000100396 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Hdac5Q9Z2V6 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Hdac5Q9Z2V6 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Hdac5Q9Z2V6 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Hdac5Q9Z2V6 Pde10a-201ENSMUST00000024647 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Hdac5Q9Z2V6 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 CT009515.4-201ENSMUST00000228165 1494 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms