Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms