Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Rprd1bQ9CSU0 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Rprd1bQ9CSU0 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms