Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Atg4aQ8C9S8 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Atg4aQ8C9S8 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Atg4aQ8C9S8 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Atg4aQ8C9S8 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Atg4aQ8C9S8 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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