Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms