Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 H2al1a-201ENSMUST00000188439 501 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-9-201ENSMUST00000103498 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 9330179D12Rik-202ENSMUST00000180811 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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