Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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BC051142Q3V0M8 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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BC051142Q3V0M8 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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BC051142Q3V0M8 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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BC051142Q3V0M8 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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BC051142Q3V0M8 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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BC051142Q3V0M8 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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BC051142Q3V0M8 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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BC051142Q3V0M8 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
BC051142Q3V0M8 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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