Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms