Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Tmem253Q3UNB8 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tmem253Q3UNB8 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Tmem253Q3UNB8 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Tmem253Q3UNB8 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Tmem253Q3UNB8 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Tmem253Q3UNB8 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms