Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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