Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Ttc39dQ0VF76 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ttc39dQ0VF76 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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