Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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