Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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