Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrp1P56183 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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