Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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SrprbP47758 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
SrprbP47758 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
SrprbP47758 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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SrprbP47758 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
SrprbP47758 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
SrprbP47758 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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SrprbP47758 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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SrprbP47758 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
SrprbP47758 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
SrprbP47758 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
SrprbP47758 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
SrprbP47758 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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