Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxraP28700 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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