Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms