Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm9689-201ENSMUST00000210009 428 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 AC100209.1-201ENSMUST00000225562 409 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Olfr418-201ENSMUST00000059754 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Olfr698-201ENSMUST00000074981 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 AC123665.5-201ENSMUST00000226648 1392 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm8818-201ENSMUST00000110797 1047 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Smim18J3QNP2 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms