Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm28038F7BCN9 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm28038F7BCN9 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Gm28038F7BCN9 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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Gm28038F7BCN9 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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Gm28038F7BCN9 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Gm28038F7BCN9 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28038F7BCN9 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Gm28038F7BCN9 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28038F7BCN9 Gm13500-201ENSMUST00000119348 824 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28038F7BCN9 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28038F7BCN9 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28038F7BCN9 n-R5s23-201ENSMUST00000122523 115 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28038F7BCN9 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28038F7BCN9 Gm11454-201ENSMUST00000144092 714 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28038F7BCN9 Gm13402-201ENSMUST00000153600 424 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28038F7BCN9 Gm22881-201ENSMUST00000157747 134 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28038F7BCN9 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28038F7BCN9 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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