Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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