Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms