Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Cpa5-203ENSMUST00000115139 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Olfr545-202ENSMUST00000216116 3496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hdac5Q9Z2V6 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Fam217a-201ENSMUST00000021851 2402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Hdac5Q9Z2V6 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Hdac5Q9Z2V6 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm7910-201ENSMUST00000117896 835 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm12126-201ENSMUST00000147717 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms