Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hmg20aQ9DC33 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms