Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Nop56Q9D6Z1 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Nop56Q9D6Z1 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Nop56Q9D6Z1 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Nop56Q9D6Z1 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Nop56Q9D6Z1 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Nop56Q9D6Z1 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Nop56Q9D6Z1 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Nop56Q9D6Z1 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Nop56Q9D6Z1 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Nop56Q9D6Z1 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm24938-201ENSMUST00000102225 110 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm8802-201ENSMUST00000118633 740 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm18362-201ENSMUST00000221786 529 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 AC130829.2-201ENSMUST00000222931 127 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Zfx-202ENSMUST00000113925 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms