Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnih3Q6ZWS4 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms