Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr943-205ENSMUST00000215770 8308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Muc19-202ENSMUST00000160242 9104 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm13081-201ENSMUST00000121527 5599 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Entpd5-201ENSMUST00000021662 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Zfp661-203ENSMUST00000110368 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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NipblQ6KCD5 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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