Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm17197-201ENSMUST00000163160 452 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm8696-201ENSMUST00000174777 385 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc8dos-201ENSMUST00000135958 586 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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