Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms