Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Rnf149Q3U2C5 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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Rnf149Q3U2C5 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Rnf149Q3U2C5 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Rnf149Q3U2C5 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Rnf149Q3U2C5 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Rnf149Q3U2C5 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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Rnf149Q3U2C5 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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Rnf149Q3U2C5 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Rnf149Q3U2C5 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf149Q3U2C5 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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