Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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