Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxc11P31313 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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