Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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RxraP28700 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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RxraP28700 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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RxraP28700 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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RxraP28700 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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RxraP28700 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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RxraP28700 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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RxraP28700 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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RxraP28700 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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