Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P20040 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P20040 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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