Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Trpm6-201ENSMUST00000040489 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sptan1P16546 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms