Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Vpreb1P13372 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms