Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm20830J3KML6 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms