Protein–RNA interactions for Protein: F6U8V3

H2-M11, Histocompatibility 2, M region locus 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M11F6U8V3 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M11F6U8V3 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms