Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clrn2B2RVW2 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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