Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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Usf3B2RUQ2 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Usf3B2RUQ2 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Usf3B2RUQ2 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Usf3B2RUQ2 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Usf3B2RUQ2 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usf3B2RUQ2 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.9 ms