Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rrn3B2RS91 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms