Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms