Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Serpina3n-201ENSMUST00000021506 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Hnrnph2-204ENSMUST00000113202 3988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm43910-201ENSMUST00000204561 3241 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm45873-201ENSMUST00000211865 1915 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Ighv5-6-201ENSMUST00000103446 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm42759-201ENSMUST00000195915 2439 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Retsat-201ENSMUST00000070597 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 AC120425.1-201ENSMUST00000225213 2360 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Mmp19-201ENSMUST00000026411 3402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Adgrl2-203ENSMUST00000168352 2151 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Plcg2-201ENSMUST00000081232 4298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Dhx30-203ENSMUST00000165596 3726 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Smpd4-203ENSMUST00000090159 4565 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm5535-208ENSMUST00000210482 1403 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm15925-201ENSMUST00000120641 1881 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 1700024J04Rik-201ENSMUST00000093146 1821 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Ddx5-201ENSMUST00000021062 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Supt5-201ENSMUST00000003527 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Aqp9-203ENSMUST00000113570 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Pln-202ENSMUST00000163319 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm13750-201ENSMUST00000117621 465 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
SrfQ9JM73 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms