Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 A630001G21Rik-201ENSMUST00000064788 1353 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Psg19-201ENSMUST00000004657 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 S100a10-203ENSMUST00000170612 477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Rabgef1Q9JM13 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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