Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Spen-201ENSMUST00000078886 12082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Amd-ps4-201ENSMUST00000118392 1003 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Cfl2-201ENSMUST00000078124 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm28852-201ENSMUST00000186666 2160 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Smg9Q9DB90 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms