Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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